Темы, которые должна затрагивать научная работа, поданная на данную секцию: геномное редактирование, исследование генома человека, клеточные технологии, направленная доставка лекарственных средств
В работе представлены данные о выживаемости мезенхимальных стволовых клеток после комбинированного действия противоопухолевых препаратов – доксорубицина и паклитаксела – с наночастицами кремния в качестве доставщиков препаратов в клетки.
Проведен ПЦР-анализ в режиме реального времени для определения генотипа по генам ADRB2, ADRB3, ответственных за генетическую предрасположенность к ожирению у студентов разной этнической принадлежности.
В настоящее время ведется поиск новых белков-эффекторов, распознающих альтернативные PAM-последовательности. Чтобы использование белка в экспериментах стало возможным, его необходимо охарактеризовать: подобрать оптимальные условия работы, установить структуру направляющей РНК и, разумеется, определить PAM-последовательность
Цель работы: разработка инструментов для определения РАМ-последовательности САS-эффекторов с помощью метода молекулярной биологии.
Протеасомы – мультисубъединичные белковые комплексы, осуществляющие деградацию внутриклеточных белков, были ранее выявлены в большом количестве в сыворотке крови. В работе показано, что стимуляция различных клеток иммунными цитокинами приводит к секреции особых форм протеасом, играющих роль в развитии иммунологических реакций, в составе внеклеточных везикул.
Кератоконус – это хроническое прогрессирующее дистрофическое заболевание роговицы, характеризующееся её истончением, растяжением, конусовидным выпячиванием. В настоящее время доказан вклад генетической обусловленности в развитие кератоконуса. Мы занамаемся изучением генетической предрасположенности к этому заболеванию. В тезисах описаны эксперименты, которые мы провели для поиска каузальных вариантов в локусе влизи гена FOXO1.
В данной работе была исследована широко экспрессируемая длинная некодирующая РНК LINC00493. Впервые была определена точная экзон-интронная структура LINC00493, её клеточная локализация, влияние на физиологию клетки. В процессе работы было также найдено, что LINC00493 имеет малую открытую рамку считывания, которая кодирует небольшой белок SMIM26. Изучено влияние на жизнеспособность клеток белка SMIM26 и транскрипта LINC00493 в отдельности.
Лиганд, индуцирующий апоптоз, связанный с фактором некроза опухоли (англ. Tumor necrosis factor (TNF)-related apoptosis-inducing ligand, TRAIL), избирательно индуцирует апоптоз в опухолевых клетках. Мембранные везикулы (МВ) из мезенхимных стволовых клеток (МСК) предоставляются перспективным методом доставки TRAIL в микроокружение опухоли. В данной работе была исследована противоопухолевая активность искусственных МВ из МСК со сверхэкспрессией TRAIL в мышиной модели рака молочной железы in vivo.
Белок Arc играет важную роль в различных типах пластичности нейронов, включая долговременную потенциацию и долговременное подавление. Ретротранспозонный GAG-подобный домен в Arc образует вирусоподобные капсиды, которые транспортируют свою мРНК в составе внеклеточных везикул в соседние клетки, обеспечивая обмен информацией между нейронами. Принимая во внимание эти свойства Arc, мы планируем оценить возможность его использования для доставки нуклеиновых кислот в различные типы клеток.
Изучение нейронов человека и их взаимодействия с нейрохимическими веществами затруднено из-за невозможности сбора первичного биоматериала.В нашей работе нами были получены линии ИПСК человека экспрессирующие элементы системы TetON-NGN2 для быстрой дифференцировки в нейроны,а также флуоресцентный кальциевый индикатор GCamp6s. Разработанный нами протокол позволяет быстро, удобно и эффективно получать значительные количества нейронов человека.
Работа посвящена изучению функциональной активности экзонуклеаз фагов Т4 и Т5, и их химер с SSB-белками для дальнейшего применения при редактировании генома методом CRISPR/Cas9. В данной работе была произведена экспрессия указанных белков в системе E.coli и системе эукариотических клеток. Оказалось, что хотя и NLS, и SSB в составе химер снижают их экзонуклеазную активность, тем не менее она остается на сравнительно высоком уровне. Наиболее активной экзонуклеазой оказалась T5FEN.
Известно, что энхансер p53 дрозофилы взаимодействует с отдалёнными от него генами, в частности, геном Xrp1, находящимся на расстоянии более 20 Mb от p53RE. Молекулярный механизм взаимодействия при этом неизвестен. В данной работе предлагается создать трансгенные линии мух с различными фрагментами гена Xrp1, позволяющие локализовать область взаимодействия p53RE и Xrp1.
Работа демонстрирует вклад внеклеточного матрикса в скорость миграции сфероидов из раковых (А549) и эмбриональных (FNX) клеток. Различия наблюдаются как на коротком (24 ч) так и на длительном (до 144 ч) интервалах, а с увеличением пассажа, скорость роста FNX приближается к A549. Поскольку было показано, что рост числа пассажей FNX связан с переходом клеток в раковое состояние, различия в скорости миграции могут служить прогностическим маркером для определения персонализированной терапии.
В работе представлено исследование цитотоксического действия катионных пептидов в отношении клеточных культур рака молочной железы с приобретенной in vitro резистентностью к Dox, и клеточных культур гастроинтестинальной стромальной опухоли с приобретенной in vitro резистентностью к иматинибу.
Гены системы свертывания крови важны для исследования как у больных, так и в популяции условно здоровых людей. Дисбаланс системы свертывания крови может привести к большому числу серьезных заболеваний, чему способствуют многочисленные факторы риска.
В данной работе были проанализированы экзомы из образцов из Биобанка НМИЦ ТПМ и северо-западного региона РФ российской популяции и описан полиморфизм 33 генов системы свертывания крови.
В данной работе были проанализированы короткие инделы без сдвига рамки считывания в популяции жителей Ивановской области. Были проанализированы их важнешие характеристики - распространенность и болезнетворность.
Работа посвящена установлению роли компонентов стромального микроокружения (ростовые факторы, цитокины, молекулы клеточной адгезии) в чувстительности клеток острого миелоидного лейкоза к химиотерапевтическим препаратам
Данная работа посвящена изучению NSUN7, мутация в котором приводит к нарушению сперматогенеза и мужскому бесплодию. В ходе работы выполнен биоинформатический анализ структуры и последовательности NSUN7, изучена взаимосвязь наличия белка и строения фиброзной оболочки у различных групп животных, проведена серия реакций in vitro метилирования с целью выявления каталитической активности, а также проведен сравнительный анализ протеомов мышей дикого типа и нокаутов.
В данной работе предлагается подход к решению задачи выявления генов, специфичных для адренокортикальных прогениторов(АКП), с использованием анализа данных секвенирования транскриптома единичных клеток (SC-Seq) надпочечников мыши. В результате фильтрации данных были обнаружены клетки, экспрессирующие маркеры АКП в допустимом интервале значений дифференциальной экспрессии.
Целью настоящей работы было создать более простой метод для получения очищенного комплекса MHC II с пептидом. Разработка данного метода может существенно упростить изучение взаимодействия главного комплекса гистосовместимости второго типа с антигенными пептидами.
В данной работе предполагалось получить первичную культуру Т-клеток, трансдуцированную несколькими вариантами химерных антигенных рецепторов (CAR), сравнить уровень экспрессии конструктов (проточной цитометрией по маркеру ко-экспрессии) и эффекторные функции CAR (по результатам Caspase 3/7 assay после ко-культивации с лимфоцитарными клеточными линиями, экспрессирующими целевые антигены). Конструкты различаются scFV (одноцепочечным антителом) и целевыми антигенами (CD19/CD20).
Выбор однонуклеотидных полиморфизмов, являющихся перспективными генетическими маркерами для изучения предрасположенности к инфекционным заболеваниям, и разработке соответствующих методик генотипирования.
Мы провели генотипирование 11 клещей, морфологически описанных как I.persulcatus, по локусу COI. Анализ показал, что 10 из них - действительно I.persulcatus, а один по митохондриальной ДНК является Ixodes pavlovskyi. Видовой статус последнего неясен, также вероятно, что между этими видами возможна гибридизация. Наша находка подтверждает это. Требуется дальнейшее выяснение масштабов гибридизации этих видов, т.к. оба они являются переносчиками различных заболеваний.